Fond razvija i stručnu suradnju sa znanstvenim i stručnim institucijama i tvrtkama, a u planu je raspisivanje natječaja za projekte i programe gospodarskih subjekata kojima će se dodijeliti sredstava za ulaganje u čistiju proizvodnju, smanjenje štetnih emisija, energetsku učinkovitost i obnovljive izvore energije.