Alergije na hranu su važne diferencijalno dijagnostički za upalne bolesti crijeva, takav pokus trebalo bi napraviti ili prije endoskopske biopsije za skupljanje uzoraka gdje IBD i preosjetljivost na hranu ostaju diferencijalne dijagnoze, ili se može provesti nakon histološke dijagnoze IBD a bi se isključili antigeni kao osnovni uzrok imunološke reakcije.