Naposljetku, cijeli ovaj ekološki pristup kulminira odabirom pogona: Magellano 50 ima dva Cumminsova motora s prijenosom linijskim osovinama, ali i dva električna motora od po 23 kW, pa su vlasniku na raspolaganju čak četiri načina da pokrene ovog ljepotana: samo dvama električnim motorima i baterijama od 21 kW, uz koje brod ima autonomiju od 5 nm; s baterijom od 42 kW i dvostruko većom autonomijom; parom generatora od po 20 kW, ili dizelskim motorima.