Haško tužiteljstvo je osobito za mandata tužiteljice Carle del Ponte vršilo konstantni pritisak na Srbiju, ističući kako imaju informacije da ga srbijanske vlasti i dalje u Srbiji štite, te da je Karadžić 2004. bio u Beogradu. 2002. godine sud u Haagu je otpečatio izmjenjenu i dopunjenu optužnicu protiv Karadžića, u kojoj su objedinjene dvije prethodne optužnice s ukupno 11 točaka, odvojene od optužnice protiv Mladića.