Granice biogeografskih regija utvrđene su temeljem vegetacijske karte Europe u mjerilu 1:2.000.000. Kad se ova granica spusti na mjerilo 1:100.000 u kojemu je rađena NATURA za Hrvatsku, onda panonska biogeografska regija zahvaća pojas uz sjevernu granicu Hrvatske koji u odnosu na vegetaciju, florne elemente i klimatske uvjete zapravo ne pripada toj regiji, s izuzetkom vrlo malih područja na krajnjem istoku.