Instrument plinsko-maseni spektrometar može biti sasvim dostatan za analizu uzoraka zemlje, tekućine ili zraka uz prethodno provedenu kvalitetnu pripremu uzorka i dobro opremljenu biblioteku (uglavnom se koristi NIST, Wiley itd.) upotpunjenu s popisom bojnih otrova i njihovih prekursora.

Od 1989. godine, kada je Applied Biosystems Inc. u suradnji sa kompanijom Sciex predstavio svoj prvi tekućinsko maseni spektrometar APIIII, konstruirano je niz tekućinsko masenih spektrometara čiji se rad zasniva na različitim tehnikama ionizacija, fragmentacije i detekcije organskih spojeva, proteina i peptida i svih ostalih biomolekula

Teški ioni prođu slično kao i laki samo im je radijus skretanja veći (maseni spektrometar).