Tektonska struktura ovog područja je u izvjesnoj mjeri labilna.Čitavo područje je pod utjecajem visoke seizmičke aktivnosti, jer se nalazi na tzv. velikom seizmogenom dubrovačkom bloku, gdje dolazi do povremenih unutrašnjih uznemirenosti ili potresne aktivnosti More gotovo u cjelosti okružuje ovo područje.Njegova temperatura ljeti uz obalu iznosi 22 - 26 stupnjeva Celziusovih te ljeti i zimi djelotvorno djeluje na klimatske prilike u ovom kraju.Njegova boja je tamnomodra do zelenkastomodra, a prozirnost mora u blizini obale iznosi i do 5 m dubine.Salinitet je prilično visoka i iznosi 38 % (posebno pogodna za dobivanje soli u Stonskom kanalu), ali je na nekim mjestima znatno manja zbog podmorskih vrulja.Razlika plime i oseke u ovom djelu Jadranskog mora ne prelazi 50 cm, ali zbog jačih morskih struja u pojedinim dijelovima može doći do povećanja vodostaja-razine mora i do 2 m. Osobito je to svojstveno u Kanalu Malog Stona.More je važno zbog aktivnosti i izvora prihoda stanovništva (ribarstvo, uzgoj školjaka, proizvodnja soli, turizam, rekreacija, pomorske prometne aktivnosti i dr.) Ovo područje ima sve osobine ugodnog mediteranskog podneblja s naglašenim dugim, mirnim, toplim, suhim i vedrim ljetima (višim temperaturama i ljetnim sušama), relativno kratkim, blagim i važnim zimama te toplijim i vlažnijim jesenima od proljeća.Klimatski je pogodnije južno od sjevernog primorja, dok u unutrašnjim udolinama nešto slabe maritimni utjecaj zbog veće visine i konfiguracije terena.Zabileženi su sljedeći prosjeci za meterološku stanicu Ston (razdoblje promatranja 1950 - 1965): srednja godišnja temperatura 15,6, srednja temperatura najtoplijeg mjeseca srpnja 24,9 i najhladnijeg mjeseca siječnja 7,3 stupnjeva Celziusovih, prosječna godišnja količina padalina 1414 mm, insolacija preko 2500 sati godišnje ili prosječno 7 sati dnevno, dok od vjetrova najučestalije pušu jugo SE (najizrazitije u Mljetskom i dijem Stonskom kanalu), bura-NE (izrazitija i jača na sjevernom primorju) te maestral-NW u Pelješkom i Mljetskom kanalu.