Dešavanja u BiH početkom 1993. godine, rušenje džamija, pljačke, izgoni i pokolj Muslimana, bili su povod za sukobe između vladike Atanasija Jevtića i onih sa kojima su se on i još neki značajni ljudi iz SPC tokom 80 - ih upustili u jeftinu dnevnopolitičku avanturu, kako je to rekao mitropolit Jovan.

Ono što su mitropolit Amfilohije i vladika Atanasije Jevtić shvatili sa zakašnjenjem od nekoliko godina, mitropolit Jovan, njihov glavni oponent iz redova Srpske pravoslavne crkve, govorio im je još 80 - ih godina.

- Ja mislim da bi papa pre toga morao da se pokloni senima stradalnika u Jasenovcu, kao što je prilikom posete Poljskoj odao poštu i žrtvama Aušvica rekao je mitropolit Jovan za današnji novosadski Dnevnik.

(Mitropolit i biskup sa učenicima Katoličke osnovne škole) Biskupa Antuna Škvorčevića danas je posjetio zagrebački mitropolit Jovan Pavlović kako bi uzvratio nedavni posjet požeškog biskupa.

U zagrebačkom hramu Preobraženja Gospodnjeg posvetu će u 18 sati predvoditi zagrebačko-ljubljanski mitropolit Jovan.

Mitropolit Jovan istaknuo je da je posjet predsjednika Mesića jedan je od najvažnijih posjeta crkvi Sv. Preobraženja te da će današnji dan biti posebice zapisan u Ljetopisu te crkve.

Nakon burnih ratnih godina koje smo svi preživjeli, rekao je mitropolit Jovan, predsjednik Mesić pokrenuo je veliki program stvaranja hrvatske države u kojoj će se odnosi izgrađivati na demokratski način, za što se, dodao je, predsjednik Mesić zauzima i u međunarodnim odnosima.

Mitropolit Jovan spomenuo je i, kako je rekao, napore oko uređenja ugovora između SPC-a i Republike Hrvatske s ciljem da se nađe što bolje rješenje tih odnosa.

Rekavši da je predsjednik Mesić neposrednim susretima s predstavnicima vjerskih zajednica u Hrvatskoj otvorio jedno novo poglavlje, mitropolit Jovan istaknuo je da je poziv upućen predsjedniku Mesiću i odgovor na takav njegov odnos.

- Mora se raditi na nacionalnom pomirenju zbog generacija koje dolaze, - naglasio je mitropolit Jovan.

- Mitropolit Jovan je čovjek mira, osoba koja posebno doprinosi izgradnji međunacionalnih odnosa u Hrvatskoj.

Mitropolit Jovan je neko vrijeme zamjenjivao bolesnog patrijarha Pavla na čelu cijele SPC.

Mitropolit Jovan i zagrebačko sveštenstvo prisustvovalo je osveštanju slavskog kolača u Opštoj pravoslavnoj gimnaziji Kantakuzina Katarina Branković koja uspješno djeluje već petu godinu i broji preko 50 učenika.

Tijekom sastanka u sjedištu Mitropolije zagrebačko-ljubljanske, mitropolit Jovan je naglasio da je dokumentiranje žrtava važan i težak zadatak.

HBK je objavio listu vjerskih predstavnika koji će se imati priliku rukovati s papom Benediktom XVI, na kojoj su mitropolit Jovan Pavlović, muftija Ševko ef.

General Gotovina i mitropolit Jovan srdačno su se pozdravili.

General Gotovina to je učinio s mnogo poštovanja, a mitropolit Jovan s velikom srdačnošću.

- Cilj je postići što bolje rezultate te se treba držati pozitivnog - objašnjava mitropolit Jovan.

Jovan dao Logosu, časopisu studenata pravoslavnog Bogoslovskog fakulteta u Beogradu. U tom intervjuu mitropolit Jovan je izneo brojne pojedinosti vezane za njegovu smenu sa nekih funkcija u Patrijaršiji, ali i mnoštvo drugih zanimljivosti.

Jedno vreme mitropolit Jovan je obavljao dužnost direktora patrijaršijske štamparije, a od 15. februara 1992. do 1. decembra 1994. godine bio je i član uređivačkog odbora Pravoslavlja, novina Srpske patrijaršije.

U obema svojim predstavkama mitropolit Jovan je izneo brojne primedbe, kritike i predloge vezane za organizaciju celokupne izdavačke delatnosti, ali sa posebnim osvrtom na probleme oko Pravoslavlja.

Upravo od tog broja Sveti arhijerejski sinod je na mesto glavnog urednika postavio gospodina Miladina Bojića, čoveka kojeg je mitropolit Jovan označio kao glavnog (mi ćemo dodati - javnog) krivca za stanje u kome se Pravoslavlje našlo.

Ipak, teško je poverovati da bi sa (ne) znanjima kakva je mitropolit Jovan pripisivao gospodinu Bojiću i crnogorska veza bila dovoljna da Bojić nije imao neke druge kvalitete - snalažljivost i dovitljivost, na primer.

Povodom toga mitropolit Jovan je dao sledeći komentar: Nema nikakve sumnje da je ispod fotografije objavljene u broju od 1. jula 1994. godine morala stajati precizna legenda koja bi jasno stavila do znanja iz koga doba potiče snimak koji se objavljuje i koji su arhijereji na njemu.

Kako god bilo, kritički raspoloženi mitropolit Jovan nije imao razumevanja za ove izraze supružanske ljubavi i oštro je prokomentarisao: Ovo je manir nepotizma i prisvajanja porodičnog monopola u novinama Srpske patrijaršije. Pošto mu je pristup Pravoslavlju bio sprečen (za razliku od urednikove supruge), mitropolit Jovan je svoje primedbe pismeno poslao Svetom arhijerejskom sinodu.

Pošto su pročitali sve ono što je mitropolit Jovan imao da im kaže o uređivanju Pravoslavlja, članovi Sinoda su u decembru 1994. doneli i odgovarajuću odluku smenili ga sa funkcije direktora patrijaršijske štamparije i uklonili iz uređivačkog odbora patrijaršijskih novina.

O postupku svoje braće u Hristu mitropolit Jovan kaže: Umesto odgovora na moje reagovanje, ili ma kakvog znaka da su moje predstavke makar i pročita ne u Sinodu, desilo se nešto neprimereno životu i radu jednog kolektiva ili zajednice ako tako hoćete.

Vest o svojoj smeni mitropolit Jovan je zvanično saznao iz štampe

U već pomenutom članku Reč čitaocima, čiji je autor bio novoizabrani glavni urednik Pravoslavlja protosinđel Atanasije Rakita, mitropolit Jovan je mogao da pročita da je 30. decembra 1994. godine održana sednica uređivačkog odbora Pravoslavlja koju je vodio Njegova Svetost patrijarh srpski G.

Iz navedenih razloga njih dvojica se mogu smatrati i najodgovornijima što mitropolit Jovan nije dobio nikakvo zvanično obaveštenje o svojoj smeni i što na sednicu na kojoj se o tome raspravljala nije bio ni pozvan ni obavešten o njenom radu.