L područje kodira strukturu kapsidnih proteina i to velikog L1 i malog L2. E područje sadrži zapise proteina odgovornih za: razmnožavanje virusa (E1 za replikaciju, a E2 za transkripciju), vezanje za citokeratin (E4), staničnu transformaciju (E5 vezivanje na receptore za čimbenik rasta) i onkogenezu (E6), a neki zapisi su nepoznate funkcije (E3).