Odjel međunarodnih poslova civilnog zrakoplovstva obavlja poslove pripreme i realizacije iz domene bilateralne i multilateralne suradnje, surađuje s međunarodnim organizacijama civilnog zrakoplovstva (ICAO, JAA, ECAC, EUROCONTROL i dr.), priprema podloge za donošenje, izmjene i dopune međunarodnih konvencija i protokola, te sudjeluje na međunarodnim sastancima u pogledu navedene tematike, priprema prijedloge za zaključivanje međunarodnih bilateralnih sporazuma iz područja civilnog zrakoplovstva, sudjeluje u pregovorima za zaključivanje međunarodnih bilateralnih sporazuma iz područja civilnog zrakoplovstva, surađuje sa zrakoplovnim vlastima drugih država iz područja bilaterale, obavlja poslove iz domene multilateralne suradnje, priprema prijedloge za zaključivanje multilateralnih sporazuma, konvencija i protokola, vodi operativne zbirke i kartoteke međunarodnih sporazuma o zračnom prometu, izučava pravna i komercijalna pitanja iz područja međunarodnog zrakoplovstva, utvrđuje pravna i operativna pitanja vezana za korištenje zračnog prostora iznad teritorija Republike Hrvatske, surađuje s predstavništvima stranih zračnih prijevoznika u Republici Hrvatskoj i svijetu, organizira poslove na odobravanju i odobrava komercijalno letenje u prostoru Republike Hrvatske, nominira zračne prijevoznike i linije u redovnom zračnom prometu, priprema podloge za odobravanje i odobrava redove letenja domaćim i stranim zračnim prijevoznicima u redovnom prometu, priprema i izdaje odobrenja za pojedinačne i serije povremenih (charter) letova inozemnih zračnih prijevoznika, pripreme dozvole za prijevoz opasnih tvari u preletu teritorija Republike Hrvatske i za slijetanje na teritorij Republike Hrvatske, organizira prijam i otpremu teleks poruka u mreži AFTN za potrebe svih odjela Uprave, predlaže i provodi mjere radi ujednačavanja nacionalnih propisa koji uređuju zračni promet i ujednačavanja rada službi odgovornih za sigurnost i upravljanje zračnim prometom, radi na promicanju politike u odnosu na radiouređaje, radi na promicanju i usklađivanju proučavanja koja se odnose na postrojenja i provedbu službi zračne plovidbe, određivanje ustroja zračnog prostora, utvrđivanje smjernica u vezi naplate pruženih usluga korisnicima i odobravanje tarifa i uvjeta primjene naknada, proučava mjere za olakšanje financiranja investicija neophodnih za rad službi koje sudjeluju u osiguranju sigurnosti zračne plovidbe.