Program Filmskog centra obuhvaća: - prikazivanje filmova nacionalne filmske baštine, svjetske klasike i suvremenog europskog filma, te posebnih programa eksperimentalnog filma i umjetničkog videa; - organiziranje namjenskih ciklusa projekcija u skladu s programima Medijske kulture u osnovnim i srednjim školama, te na taj način omogućiti školama i nastavnicima kvalitetno i potpuno ostvarivanje programskih zadataka i ciljeva medijskog odgoja i obrazovanja; - organiziranje predavanja i filmskih tribina, koristeći pri tome mogućnosti koje pruža koncentracija nastavnih i znanstvenih djelatnika u Hrvatskoj kinoteci, na ADU, Akademiji likovnih umjetnosti, Filozofskom fakultetu i Učiteljskoj akademiji, koristeći do sada već uspostavljene brojne veze sa znanstvenicima na polju audiovizualnih medija u svijetu; - izložbenu djelatnost organiziranjem izložbi vezanih uz povijest filma i audiovizualnih medija, dijelom iz domaćih fondova (Hrvatska kinoteka, Tehnički muzej, Školski muzej) i dijelom iz stranih filmskih i kulturnih centara; - edukativnu djelatnost u užem smislu, omogućavajući i pojedinačno korištenje filmskog fonda (individualni i grupno gledanje filmova presnimljenih na video u prostorijama Filmskog centra, pružanje pomoći učenicima i studentima u izradi seminarskih, diplomskih i drugih radova i dr.); - Filmski centar trebao bi biti domaćinom specijaliziranih filmskih priredbi kao što su Dani hrvatskog filma, Festival europskog filma, Svjetskog festivala animiranih filmova i sl.