Za svojih dvadeset knjiga i više od četiri stotine uglavnom stručnih članaka dobio je preko stotinu nagrada u znanosti i literarnim disciplinama, uključujući i dvije Pulitzerove nagrade, za knjigu On Human Nature (1978) - u izdanju Jesenskog i Turka O ljudskoj prirodi - i knjigu koju je napisao s Bertom Holldoblerom, The Ants (1990), zatim Američku nacionalnu medalju za znanost, nagradu Crafoord, koju dodjeljuje Kraljevska švedska akademija znanosti za područja koja nisu pokrivena Nobelovom nagradom, japansku Međunarodnu nagradu za biologiju, talijansku Predsjedničku medalju i nagradu Nonino, i Franklinovu medalju Američkog filozofskog društva.