Grad je pretrpio težak udarac 1349 godine, kada je gotovo polovica mještana je pomrla od kuge. 1491 godine Cork je uvučen u engleski Rat dviju ruža, tada je Perkin Warbeck pretendent na engleski prijesto, uspio pridobiti dio građana Corka u svojem nastojanju da sruši Henrika VII., kralja Engleske.