Bergoglio je tada provodio vatikanske mjere protiv teologije oslobođenja, pa iz toga doba sežu optužbe isusovaca Orlanda Yorija i Francisca Jalicsa da ih je Bergoglio, nakon što su se oglušili o njegovu naredbu da napuste favelu u kojoj su živjeli, predao u ruke hunti, koja ih je pet mjeseci mučila u zloglasnom zatvoru Mornaričke tehničke škole (ESMA).