Glifozat, njegovi toksični razgradni produkti (npr. aminometilfosfonska kiselina, AMPA) i primjese u patentiranim formulacijama (npr. polietoksilirani etilenamini, POEA) postali su glavna zagađivala podzemnih voda i rijeka (Institut Francais de l ' Environnement, Orleans, IFEN 2006).