Odsjek za formalno ispitivanje, administrativne poslove i vođenje registara obavlja poslove vezane uz ispitivanje i obradu prijava patenata i podnesaka te zahtjeva izdavanje Svjedodžbe o dodatnoj zaštiti u odnosu na formalno-pravne uvjete; priprema i provjerava podatke za objavu prijava patenata i patenata u službenom glasilu Zavoda; vodi Registar prijava patenata, Registar patenata i Registar Svjedodžbi o dodatnoj zaštiti; obavlja provjeru uplata upravnih pristojbi i naknada troškova postupka za stjecanje patenta i održavanje u vrijednosti patenta, konsenzualnog patenta i Svjedodžbe o dodatnoj zaštiti te vodi postupak za oslobađanje od njihovog plaćanja; izdaje Svjedodžbe o dodatnoj zaštiti, svjedodžbe o pravu prvenstva, izrađuje opise objavljenih patentnih prijava, izdaje uvjerenja i izvatke iz registara, izrađuje i izdaje isprave o patentu i patentne spise, te ostale potvrde i uvjerenja; obavlja poslove vezane uz upis promjena u registre; zaprima i rješava prigovore povodom formalno-pravnih razloga te informira o postupcima u tijeku.