Kada je riječ o instrumentalnom opusu, tipični primjeri za to su neke fantazije, koje prethode fugama poput one iz Fantazije i fuge, g-mol (BGA XV, 177) za orgulje, ili one iz Kromatske fantazije i fuge, d-mol za cembalo, odnosno klavir, koje obiluju kromatikom, alteriranim akordima, kromatskim i enharmonijskim modulacijama, a forma im je slobodna, improvizacijska.