Nuspojave TJ-9 su rijetke ali uključuju interstialni pneumonitis (posebno kada se koristi u spoju sa interferonom za liječenje kroničnog hepatitisa) i hepato-toksičnost.

Bolest dišnog sustava koja pogađa osobito ljude treće životne dobi - pneumonitis, postaje sve češći uzrok smrti u SAD-u i time je istisnuo ubojstva iz prvih 15 uzroka smrti u Americi, stoji u priopćenju Državnog centra za kontrolu i prevenciju bolesti.

Alergijska hunjavica, bronhalna astma, alergijski pneumonitis - bolesti su prouzrokovane preosjetljivošću na gljivične antigene, a nastaju udisanjem konidija plijesni ili njihovim dodirom s kožom.

1. Akutna HIV-infekcija (Akutni retrovirusni sindrom) razvija se nekoliko tjedana nakon infekcije HIV-om; najčešće se klinički očituje kao blaga benigna virusna bolest i prolazi nezapaženo; traje obično 2 - 3 tjedna, a simptomi su: vrućica, gubitak apetita, opći algički sindrom i drugi opći simptomi, limfadenopatija, hepatosplenomegalija, osipi, ponekad hepatitis, pneumonitis, neurološke i mukokutane manifestacije.

Nuspojave ovih lijekova su vrlo ozbiljne, a uključuju jetrenu bolest, pneumonitis te supresiju koštane srži.

Uz alergijske bolesti dišnih putova i kože, pojavljuje se i upala pluća (hipersenzitivni pneumonitis, intersticijalna granulomatoza) i gripi nalik groznica ovlaživača.

Nuspojave primjene radioaktivnog joda u terapijske svrhe su rijetke, a tu se ubrajaju mučnina, povraćanje, umor, glavobolja, još rjeđe prolazno smanjenje broja krvnih stanica, tj. supresija koštane srži, upala žlijezda slinovnica, pneumonitis (zbog zadržavanja joda u plućima u bolesnika s plućnim metastazama), prolazno smanjenje funkcije jajnika i smanjenje broja spermija te povećanje broja mutacija, zbog čega se bolesnicima savjetuje da kontroliraju začeće 6 - 12 mjeseci nakon primjene radioaktivne terapije.

Kao i kod liječenja drugim alfa interferonima, tijekom liječenja Pegasysom zamijećeni su plućni simptomi koji su uključivali dispneju, plućne infiltrate, upalu pluća i pneumonitis.

Ukoliko je infekcija prisutna u terminu, tada novorođenče može zadobiti konjunktivitis, a ponekad i pneumonitis.