Samostalni odjel za unutarnji nadzor, financijsko upravljanje i kontrolu sustavno provodi nadzor rada DM/KU RH u inozemstvu, upravnih organizacija i unutarnjih ustrojstvenih jedinica Ministarstva; provodi naknadne kontrole; provjerava i utvrđuje usklađenost poslovanja s međunarodnim konvencijama, zakonima, propisima, naputcima i utvrđenim internim procesima i postupcima, te misijom i ciljevima Ministarstva, kako bi se postiglo zakonito, djelotvorno, učinkovito, usklađeno i etično obavljanje poslova iz djelokruga rada; nadzire ustroj, strukturu, popunjenost i upravljanje kadrovima, organizaciju rada i unutarnje odnose; vrši kontrolu poslovanja i propisane dokumentacije; provjerava način i kvalitetu komunikacije, prethodnih kontrola i izvješćivanja; utvrđuje stanje objekata u vlasništvu te način upravljanja povjerenom imovinom i sredstvima, stupanj opremljenosti DM/KU te unutarnjih ustrojstvenih jedinica, stanje sigurnosti i uvjete života i rada zaposlenih; utvrđuje propuste, nepravilnosti i nezakonitosti; daje upute za pravilan, propisan i profesionalan rad; sastavlja izvješća o nadzoru s prijedlogom mjera za otklanjanje propusta, nepravilnosti i nezakonitosti, te standardizaciju i unaprjeđenje rada; po potrebi inicira pokretanje postupka za utvrđivanje odgovornosti za povredu službene dužnosti; u dijelu financijskog upravljanja i kontrola (FMC) sudjeluje i koordinira uspostavu, provedbu i razvoj financijskog upravljanja i kontrola na svim razinama, u svim ustrojstvenim jedinicama MVPEI i DM/KU; pomaže voditelju za FMC u izradi i izmjenama Plana provedbe i razvoja FMC u MVPEI; koordinira, sudjeluje i pomaže u izradi popisa i opisa poslovnih procesa, izradi knjige/mape poslovnih procesa, utvrđivanju i procjeni mogućih rizika; sudjeluje i pomaže pri uspostavi prethodnih kontrola, te provodi naknadne kontrole; sudjeluje i pomaže voditelju u praćenju, procjeni i razvoju FMC; sudjeluje u pripremanju izvješća o stanju FMC; podnosi godišnja izvješća; predlaže godišnje planove rada; surađuje s Kabinetom ministra, državnim tajnicima, osobom zaduženom za nepravilnosti u MVPEI, Samostalnim odjelom za unutarnju reviziju i ostalim ustrojstvenim jedinicama Ministarstva; surađuje sa Središnjom harmonizacijskom jedinicom Ministarstva financija; obavlja poslove po nalogu ministra, te ostale poslove iz svoje nadležnosti.