U okviru Odsjeka za upravljanje rizikom, suzbijanje krijumčarenja i istrage obavljaju se poslovi prikupljanja informacija i podataka koji se odnose na suzbijanje prijevara te njihova prosljeđivanja Odjelu za nadzor u Carinarnici i njegovim Odsjecima; poslovi obrade i analize prikupljenih podataka; poslovi izrade prijedloga lokalnih profila rizika za sustav upravljanja rizicima radi ciljanog otkrivanja prijevara i selektivnog carinjenja pošiljaka; provode se preventivne mjere za suzbijanje krijumčarenja svih vrsta roba, zaštićenih biljnih i životinjskih vrsta, opojnih droga i prekusora, oružja, eksploziva, radioaktivnih materijala i drugih opasnih tvari; provode se mjere carinskog i trošarinskog nadzora te nadzora vezanog uz posebne poreze kao i provjera u okviru ciljanih operativnih akcija putem mobilnih jedinica u cilju suzbijanja prijevara na području Carinarnice, samostalno ili u koordinaciji s tijelima državne uprave; u svom radu se koriste rentgen-uređajima i ostalim materijalno-tehničkim sredstvima; provode ispitne i izvidne postupke u predmetima prijevara; provode mjere izvanrednih provjera putničkog prometa, vozila i robnih pošiljaka s aspekta prijevara i prikupljanja dokaza za njihovo procesuiranje; izrađuju izvješća i analize iz djelokruga Odsjeka.