Odsjek za ribarstveni monitoring centar vodi i održava operativni satelitski sustav nadzora i praćenja ribarskih plovila; prikuplja, pohranjuje, ažurira i obrađuje podatke o ribarskim plovilima i njihovim geografskim lokacijama dostavljene kroz uređaje za praćenje instalirane na plovilima; nadzire i prati ribarska plovila registrirana u Republici Hrvatskoj, plovila zajednice i trećih zemalja; komunicira i razmjenjuje podatke s drugim monitoring centrima i Europskom Komisijom; sudjeluje u izradi Nacionalnog programa razvoja ribarstva; izrađuje podloge za donošenje mjera odgovornog i održivog gospodarenja morem u svom djelokrugu; izravno surađuje s ribarskom i drugom nadležnom inspekcijom; izravno komunicira s Ministarstvom mora, prometa i infrastrukture; priprema stručne podloge za donošenje zakona i drugih propisa iz morskog ribarstva.