U okviru Službe za Intrastat obavljaju se poslovi suradnje sa Državnim zavodom za statistiku (DZS) s ciljem uvođenja istraživanja Intrastat (statistika robne razmjene između zemalja članica Europske unije) u statistički sustav Republike Hrvatske, poslovi suradnje s DZS-om radi unapređivanja i realizacije projekta, sudjelovanje u zajedničkim projektima s DZS-om, praćenje propisa vezanih za robnu razmjenu zemalja članica Europske unije INTRASTAT, poslovi podrške korisnicima, poslovi izrade specifikacije za aplikaciju Intrastat, suradnje sa informatičkim stručnjacima pri izradi aplikacije, analize rezultata dobivenih testiranjem aplikacije, definiranje sadržaja i analiziranje izvora za izradu Registra za Intrastat, specificiranje funkcionalnosti Registra i njegove povezanosti sa drugim bazama podataka i aplikacijama, definiranje načina ažuriranja sadržaja Registra, prikupljanje, kontrola, obrađivanje, analiziranje i čuvanje statističkih podataka o robnoj razmjeni među državama članicama EU, dostava prikupljenih podataka DZS-u, ispravke utvrđenih nepravilnosti za DZS-u, vođenje propisanih evidencija u svezi prikupljanja statističkih podataka, izrade radnih materijala, priručnika, uputa u suradnji sa DZS-om, poslovi edukacije i osposobljavanja carinskih službenika za rad na projektu Intrastat, informiranje i edukacija gospodarskih subjekata o sustavu Intrastat, kreiranje i ažuriranje link-a na službenim stranicama Carinske uprave radi pružanja pravovremenih informacija, obavijesti i uputa svim zainteresiranim subjektima, sastavljanje i pripremanje prijedloga za izradu novih podzakonskih propisa za poboljšanje rada i usklađivanja zakonske regulative Republike Hrvatske i Europske unije.