Hidrofilne se površine ne podnose sa silikonima.Silikoni i slični materijali, kao npr silani spomenuti kod tuš kabina, hidrofobiraju površine.Ukoliko silikon dospije na hidrofilnu površinu, voda se više ne može raširiti u film.Kod fotokatalitičnih stakala za prozore ili fasade kao brtva između stakla i okvira često se upotrebljavaju silikonske mase.One sadrže uljaste sastavne dijelove koji također nakon stvrdnjavanja iskliznu van iz fuge na staklenu površinu.Ako su fotokatalitična stakla na taj način postavljena, rubno područje postaje hidrofobno i funkcija je ometena. Kod visokoreflektirajućih, srebrnasto sjajnih slojeva na vanjskoj strani, silikonski sloj na rubu stakla uzrokuje veće prihvačanje prljavštine a time i neravnomjeran izgled stakla.Kvaliteta silikona, a posebno sadržaj ulja, određuje širinu hidrofobiranog ruba.Visokovrijedne varijante silikona siromašne uljima zasad nisu pogodne za brtvljenje fotokatalitičnog stakla.Riješenje tog problema su mase za brtvljenje bez silikona npr na bazi ms polimera.Ti umjetni materijali bez silikona mogu osigurati hidrofilnu funkciju cijelokupne staklene površine sve do zabrtvljene fuge.Alternativno se fotokatalitična stakla mogu montirati sa sustavima suhog ostakljivanja (brtveni profili) u PVC ili aluminijske prozorske i fasadne profile.