Upravu biskupijom preuzeo je 16. srpnja 2005. »U vrijeme komunizma bio je jaki politički pritisak na Crkvu, ali je na drugoj strani za nas bogoslove to bilo dobro iskustvo, jer smo se družili i zajednički pripremali za predstojeći nam rad u totalitarističkom okruženju«, rekao nam je biskup Judak osvrnuvši se na svoje studentsko razdoblje života i svjedočeći zadovoljstvo što je u takvim okolnostima »tamne strane povijesti« dobio zvanje za svećenika.