Odjel za trgovinske mjere zadužen je za provedbu Uredbe o načinu raspodjele količine roba u okviru carinskih kvota u odnosu na odredbe sporazuma o trgovini i drugih međunarodnih sporazuma koje je Republika Hrvatska sklopila s državama članicama Svjetske trgovinske organizacije, kao i s drugim pojedinim državama; sudjeluje u raspodjeli carinskih kvota koju za pojedine poljoprivredne proizvode provodi međuresorno povjerenstvo, te sudjeluje u usklađivanju legislative sa zahtjevima Europske unije glede provedbe međunarodnih trgovinskih sporazuma; provodi mjere poticanja prodaje i potrošnje koje obuhvaćaju promicanje utrživanja i poboljšanja kakvoće, potporu pripremi proizvoda za tržište i potporu potrošnji; priprema javne natječaje; postupke i upute za izvođenje mjera tržišno-cjenovne politike s područja trgovinskih mjera sukladno s nacionalnim zakonodavstvom; u skladu s preuzetim obvezama odjel se priprema za izvođenje zakonodavstva EU s područja svog rada i priprema izvedbene postupke, upute za rad kao i upute, te detaljnije informacije za korisnike; obrađuje i odobrava zahtjeve, rješava žalbe u I. stupnju, izvještava Ministarstvo i institucije EU, surađuje s nacionalnim i međunarodnim organizacijama.