Samostalni odjel pruža objektivna jamstva i savjetodavnog je karaktera u cilju poboljšanja poslovanja, potiče i predlaže uvođenje sistematskog, discipliniranog pristupa radu kojim se unaprjeđuje djelotvornost procesa vezanih za upravljanje rizicima, kontrolu i odgovorno upravljanje; neovisno na temelju strateškog i godišnjeg plana unutarnje revizije obavlja unutarnju reviziju u Ministarstvu, procjenjuje i unaprjeđuje učinkovitost upravljanja rizicima i sustav financijske odgovornosti; obavlja reviziju rada kako bi se osiguralo poštivanje zakona i drugih propisa koji se odnose na djelokrug rada Ministarstva, izrađuje izvješća s preporukama za poboljšanje poslovanja, provodi reviziju nad utrošcima proračunskih sredstava radi sprječavanja eventualnih zlouporaba, izvješćuje i upozorava ministra na uočene nepravilnosti.