Na primedbu studenata Bogoslovskog fakulteta, koji su sa mitropolitom Jovanom obavili intervju za časopis Logos, da njegova smena nije prvi slučaj da se u Patrijaršiji vrše smenjivanja preko noći i iza leđa, bez ikakvog obrazloženja, mitropolit je odgovorio: Doista se pokazuje da postoje izvesni krugovi uticajnih faktora, da se tako izrazim, koji žele da utiču na život Crkve odbacujući nepouzdane i birajući ljude koji više slušaju no što misle svojom glavom s ciljem što potpunijeg obavljanja poverenog im posla.