Prema novijim pokazateljima primjena probiotika indicirana je kod: proljeva koji su posljedica primjene antibiotika, proljeva koji se javljaju na putovanjima, dječjih proljeva uzrokovanih Rotavirusom, proljeva koji su posljedica kontaminacije hrane raznim mikroorganizmima, upalnih bolesti crijeva (Ulcerozni kolitis i Krohn), sindroma iritabilnog crijeva, infekcije s Helicobacter pylori, nutritivnih i drugih alergija, kod astme, malignih bolesti, kardiovaskularnih bolesti i kod drugih infekcija, konstipacije, intolerancije laktoze, za snižavanje kolesterola, za poboljšanje imunološke funkcije, infekcija mokraćnih puteva.