Mott, nagradu Instituta za istraživanje raka General Motors, nagradu za klinička istraživanja Saveza europskih instituta za rak, Paul-Ehrlich-Ludwig Darmstätter, Jung, nagradu Charles Rudolphe Brupbacher u Zurichu, Prince Mahidol Award u Bankoku, Raymond Bourgine Award u Parizu, Coley-Award u New Yorku, Life Science Achievement Award Američkog udruženja za istraživanje raka u San Diegu i naposlijetku, dobitnik je Nobelove nagrade za medicine 2008. Primio je počasne doctorate Sveučilišta u Chicagu, Umeå u Švedskoj, Sveučilišta u Pragu, Salford u Velikoj Briitaniji, Helskinki u Finskoj, Erlangen-Nürnberg i Würzburg u Njemačkoj, te Sveučilišta Buenos Aires u Argentini i Ferrera u Italiji.