U Odjelu Trošarinski ured za vezu obavljaju se poslovi izrade naputaka i mišljenja za provedbu propisa vezanih uz kretanje trošarinskih proizvoda; suradnje s drugim tijelima u poslovima iz svoga djelokruga; razmjene informacija vezanih uz kretanje trošarinskih proizvoda te razmjene podataka iz SEED baze podataka s drugim zemljama članicama i EK; nadzora i kontrole odlaznih i dolaznih MVS zahtjeva (verifikacija kretanja trošarinske robe); primanja i slanja EWSE poruka (poruke ranog upozoravanja), rješavanja o zahtjevima iz drugih zemalja članica upućenih putem njihovih trošarinskih ureda za veze te obrada i prosljeđivanje zahtjeva koji se upućuju u druge zemlje članice posredstvom nacionalnoga Trošarinskog ureda za vezu; nadzora pravovremenosti rješavanja pitanja razmjene podataka s drugim državama članicama; nadzora ispravnosti unesenih podataka u SEED bazu podataka; pružanja stručne pomoć carinarnicama u provedbi procedura vezanih uz kretanje trošarinskih proizvoda; definiranja korisničkih zahtjeva za uvođenje informatičke podrške; trošarinskog nadzora nad pravilnom provedbom propisa, naputaka i mišljenja; educiranja carinskih službenika i gospodarskih subjekata o primjeni trošarinskih propisa vezanih uz kretanje trošarinskih proizvoda.